از آنجایی که در فرآیند اعلام نتایج آزمون کنکور ۹۷ رشته‌های علوم پزشکی ناهماهنگی و به تبع آن ابهاماتی پیش آمد، متأسفانه برخی از رؤسا و معاونان آموزشی واحد‌های دانشگاه آزاد اسلامی بدون توجه به دستورالعمل‌های سازمان مرکزی اقدام به ثبت نام داوطلبان گروه پزشکی کردند که سرپرست دانشگاه آزاد اسلامی پس از اطمینان کامل از این اقدام غیرقانونی و اثبات آن از سوی مراجع نظارتی دانشگاه، این مدیران را از سمت‌های خود عزل کرد.

همچنین عزل دو رئیس واحد متخلف دانشگاه آزاد اسلامی از سوی مجموعه‌های نظارتی دانشگاه در حال بررسی است